華東理工大學(xué)生物工程學(xué)院的辦學(xué)歷史起源于1955年國(guó)內(nèi)最早成立的我校抗生素制造工學(xué)專業(yè)。1972年上海科學(xué)技術(shù)大學(xué)生物系調(diào)入我校，1980年抗菌素專業(yè)更名為生物化學(xué)工程專業(yè)，1982年生物化學(xué)工程系成立。1986年食品工程專業(yè)招生。1996年生物工程學(xué)院成立。

　　學(xué)院（系）于1991年獲批全國(guó)第一個(gè)生物化工博士點(diǎn)，1995年建成生物反應(yīng)器工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，1996年成立國(guó)家生化工程技術(shù)研究中心（上海）。2002年生物化工被批準(zhǔn)為國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科，2008年生物工程被批準(zhǔn)為國(guó)家特色專業(yè)，2015年國(guó)內(nèi)第一個(gè)生物工程博士學(xué)位授權(quán)一級(jí)學(xué)科獲得批準(zhǔn)。

　　學(xué)院（系）堅(jiān)持生物學(xué)與工程學(xué)相結(jié)合的辦學(xué)理念，突顯生物過(guò)程工程學(xué)科特色，強(qiáng)化專業(yè)教學(xué)與科研、產(chǎn)業(yè)間互動(dòng)，累計(jì)為國(guó)家培養(yǎng)出楊勝利院士、李永舫院士、劉昌勝院士為代表的9000多位具有扎實(shí)工程學(xué)基礎(chǔ)和生物學(xué)基礎(chǔ)、注重實(shí)踐和創(chuàng)新能力的高素質(zhì)優(yōu)秀人才。

　　學(xué)院現(xiàn)設(shè)生物工程、生物科學(xué)、生物技術(shù)、食品科學(xué)與工程、食品質(zhì)量與安全5個(gè)本科專業(yè)。研究生培養(yǎng)設(shè)置了生物工程（一級(jí)學(xué)科）、生物化工（二級(jí)學(xué)科）、生物學(xué)（一級(jí)學(xué)科）、食品科學(xué)（二級(jí)學(xué)科）4個(gè)碩士點(diǎn)，生物工程（一級(jí)學(xué)科）、生物化工（二級(jí)學(xué)科）、生物化學(xué)與分子生物學(xué)（二級(jí)學(xué)科）3個(gè)博士點(diǎn)，以及生物工程、食品工程2個(gè)專業(yè)學(xué)位領(lǐng)域。學(xué)院擁有國(guó)內(nèi)外頂尖的學(xué)科帶頭人和一大批中青年學(xué)術(shù)帶頭人及學(xué)術(shù)骨干，師資力量雄厚，梯隊(duì)結(jié)構(gòu)合理。現(xiàn)有教職工182人，其中專任教師中具有正高職稱40人，副高職稱56人；博士生導(dǎo)師40人、碩士生導(dǎo)師82人。

　　學(xué)院擁有生物反應(yīng)器工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和國(guó)家生化工程技術(shù)研究中心（上海）兩個(gè)國(guó)家級(jí)科研基地和若干研究所，承擔(dān)了一大批國(guó)家級(jí)科研項(xiàng)目和重大橫向課題，取得了數(shù)十項(xiàng)省部級(jí)、國(guó)家級(jí)科技獎(jiǎng)項(xiàng)。學(xué)院正以繼承傳統(tǒng)、保持優(yōu)勢(shì)、開(kāi)拓創(chuàng)新的步伐，朝著建設(shè)國(guó)際一流的研究型生物工程學(xué)院目標(biāo)邁進(jìn)。